Le fonds contient 17 séries. Elles reflètent les activités militantes de Charles Philipona ainsi que les recherches documentaires effectuées dans le cadre de son enseignement ou de ses travaux personnels. Le fonds contient des tracts, des documents internes à des groupes, des coupures de presse, des brochures, livres et périodiques, des affiches et quelques photographies.
Ces dossiers reflètent des domaines d'intérêts de Charles Philipona sur une période de 50 ans. Ils contiennent également des documents utilisés dans le cadre de ses enseignements et d'autres relatifs à ses études universitaires. Les dossiers regroupés dans cette série se présentaient sous la forme de classeurs ou de dossiers suspendus (parfois de chemises plastiques liées entre elles par un élastique). Ces unités physiques ont été conservées telles qu'elles se présentaient au moment du versement. Nous n'avons pas cherché à effectuer des regroupements thématiques qui auraient détruit le classement original. Une vingtaine de dossiers ont toutefois été extraits pour rejoindre d'autres séries plus nettement liées à l'activité militante de Charles Philipona.
Coupures de presse, photocopies d'ouvrages, notes manuscrites (env. 1979-2006). Un numéro du périodique L'employé en lutte. Le pacte germano-soviétique, n° 8, Paris, [après 1971]. Contenu d'un classeur conservé tel qu'il a été versé.
Documentation et notes de cours universitaires. Articles de presse, couvertures, manchettes (documents autour d'Anna Göldin, Michée Chauderon), photocopies d'ouvrages. Documents autour de l'exorcisme.
Divers textes, articles, coupures de presse, documents académiques. notes manuscrites. Dossiers de séminaire de Jean-Philippe Jaccard 2003-2004, extraits d'ouvrages photocopiés, annotations, notes de cours de Wladimir Berelowitch 2006-2007, cartes. Dossier de séminaire de L. Mysyrowicz, travail de séminaire de Charles Philipona sur l'ouvrage de Boris Nolde, <span style="font-weight: normal;">La formation de l'empire russe <span style="font-weight: normal;">pour le séminaire de L. Mysyrowicz.
Dossier de préparation pour un film documentaire intitulé "Quand Athènes mourrait de faim... Octobre 1941-octobre 1944", Genève, TVCO, 1991 (26 mn.), réalisé par René Merglen, conseillers pédagogiques : André Lathion et Charles Philipona (divers documents, correspondance, photographie).