Le fonds contient 17 séries. Elles reflètent les activités militantes de Charles Philipona ainsi que les recherches documentaires effectuées dans le cadre de son enseignement ou de ses travaux personnels. Le fonds contient des tracts, des documents internes à des groupes, des coupures de presse, des brochures, livres et périodiques, des affiches et quelques photographies.
Correspondance de R. Bimpage à Charles Philipona au sujet de la signature d'Adolf Hitler, coupures de presse, tirés-à-part, dossiers de _L'Express _30.11.1961-18.01.1962, illustrations.
Divers textes, articles, coupures de presse, documents académiques. notes manuscrites. Dossiers de séminaire de Jean-Philippe Jaccard 2003-2004, extraits d'ouvrages photocopiés, annotations, notes de cours de Wladimir Berelowitch 2006-2007, cartes. Dossier de séminaire de L. Mysyrowicz, travail de séminaire de Charles Philipona sur l'ouvrage de Boris Nolde, <span style="font-weight: normal;">La formation de l'empire russe <span style="font-weight: normal;">pour le séminaire de L. Mysyrowicz.
Coupures de presse, un tract relatif au Sommet mondial de la société de l'information, communiqué de la Fédération internationale des journalistes, tract de Reporters sans frontières, documents d'Amnesty International, dossier de 2002 et 2001 relatif à la mission d'observation du procès de Hamma Hammami par Christian Grobet et Alain Werner, rapport de la LSDH de 2000.