Le fonds contient 17 séries. Elles reflètent les activités militantes de Charles Philipona ainsi que les recherches documentaires effectuées dans le cadre de son enseignement ou de ses travaux personnels. Le fonds contient des tracts, des documents internes à des groupes, des coupures de presse, des brochures, livres et périodiques, des affiches et quelques photographies.
La série d’affiches (série 1) présente un large panel de productions graphiques des mouvements contre-culturels romands. Les publications (série 2) donnent un aperçu des lectures militantes et artistiques de Pierre Biner. Les dossiers relatifs à des groupes (série 3) comprennent essentiellement des documents publiés (tracts, appels, communiqués, etc.) et des coupures de presse. Les dossiers documentaires (série 4) également.